Das hat anscheinend weniger mit Priorisierung der Dateien zu tun, als eher damit das die Effekte welche bei dir jetzt nicht mehr anspringen wollen in OA auf anderen Basisklassen aufbauen. Was funzt wird gleich geblieben sein, was nicht funzt ... musst du nachjustieren.
http://community.bistudio.com/wiki/AllInOne_Config
^^ hierin die benötigten Klassen von A2 und OA vergleichen, sollte Aufschluss geben.